سامانه جامع تجارت در واقع سامانه ای هدفمند است که وظیفه یکپارچه سازی، نظارت بر فرآیند تجارت را با هدف ایجاد سامانه واحد برای کلیه بازرگانان و فعالان اقتصادی تهیه و طراحی نموده است، از این سامانه برای انجام کلیه مبادرات تجاری استفاده می شود و با استفاده از آن پدیده ی قاچاق کاهش خواهد یافت،این سامانه نقش یک واسطه را در میان پنجره واحد گمرک، پنجره واحد حمل و نقل، پنجره واحد مجوزها و پنجره واحد ارزی دارد.
سامانه جامع تجارت از دو زیرسامانه وسه سامانه جانبی برای انجام اهداف خود استفاده می کند که عبارتند از:
1-زیر سامانه حوزه تجارت داخلی: مدیریت کلیه امور مرتبط با انتقال مالکیت، مکان و نگهداری در حوزه ی کالای هدف.
2-زیر سامانه تجارت فرامرزی: مشاهده و پیگیری و جلوگیری از ورود تکراری اطلاعات کلیه فعالیت های مزبور به امور حمل و نقل، بانکی و بیمه ای، اخذ مجوزها و امور گمرکی.
3-سامانه جانبی رهگیری: مدیریت شناسه های رهگیری و پاسخ به استعلام های مرتبط.
4-سامانه جانبی شناسه کالا: ثبت اطلاعات شناسه کالا و شناسه مرتبط.
5-سامانه جانبی جامع انبارها: مدیریت ورود و خروج کالا از مراکز نگهداری در حوزه کالای هدف.
سامانه جامع تجارت در بخش داخلی با هدف یکپارچه سازی اطلاعات و رصد کالا در زنجیره تجاری از تولید و واردات تا سطح خرده فروشی می باشد. در سامانه تجارت داخلی امکان ثبت اطلاعات ورود کالا به زنجیره واردات و تولید، خرید و فروش، حمل و انبارش در سطح شناسه کالا و شناسه رهگیری ایجاد شده است
لازم به ذکر است که در آینده نه چندان دور سامانه جامع تجارت با سامانه مودیان لینک خواهد شد و اطلاعات بارگذاری شده توسط مودیان قابل مقایسه و رد گیری خواهد بود.